Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMO7DNF2Z398 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO7DNF2Z398 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms