Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I0

PCDHA13, Protocadherin alpha-13, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA13Q9Y5I0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PCDHA13Q9Y5I0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHA13Q9Y5I0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHA13Q9Y5I0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms