Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PARP4Q9UKK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PARP4Q9UKK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PARP4Q9UKK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms