Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FANCLQ9NW38 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FANCLQ9NW38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCLQ9NW38 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCLQ9NW38 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms