Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAJC17Q9NVM6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC17Q9NVM6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms