Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD4Q9HD90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEUROD4Q9HD90 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD4Q9HD90 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD4Q9HD90 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms