Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC22Q9HCG8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC22Q9HCG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CWC22Q9HCG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC22Q9HCG8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms