Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF2Q99470 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF2Q99470 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms