Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT9Q92600 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT9Q92600 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT9Q92600 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms