Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC27Q6P3X3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC27Q6P3X3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms