Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD4Q5XG99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD4Q5XG99 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD4Q5XG99 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms