Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CT47A1Q5JQC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47A1Q5JQC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47A1Q5JQC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms