Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDRF1Q3B7T1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EDRF1Q3B7T1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms