Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA3Q16787 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA3Q16787 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
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