Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKD1Q15139 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKD1Q15139 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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