Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HNF4GQ14541 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HNF4GQ14541 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms