Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TFCP2Q12800 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TFCP2Q12800 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TFCP2Q12800 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TFCP2Q12800 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
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