Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TFCP2Q12800 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TFCP2Q12800 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TFCP2Q12800 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
TFCP2Q12800 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TFCP2Q12800 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TFCP2Q12800 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TFCP2Q12800 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TFCP2Q12800 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TFCP2Q12800 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TFCP2Q12800 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TFCP2Q12800 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
TFCP2Q12800 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TFCP2Q12800 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TFCP2Q12800 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TFCP2Q12800 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TFCP2Q12800 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TFCP2Q12800 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TFCP2Q12800 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TFCP2Q12800 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TFCP2Q12800 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TFCP2Q12800 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TFCP2Q12800 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TFCP2Q12800 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TFCP2Q12800 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TFCP2Q12800 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TFCP2Q12800 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TFCP2Q12800 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TFCP2Q12800 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TFCP2Q12800 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TFCP2Q12800 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TFCP2Q12800 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TFCP2Q12800 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TFCP2Q12800 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TFCP2Q12800 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TFCP2Q12800 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TFCP2Q12800 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TFCP2Q12800 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TFCP2Q12800 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TFCP2Q12800 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TFCP2Q12800 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TFCP2Q12800 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TFCP2Q12800 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TFCP2Q12800 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TFCP2Q12800 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TFCP2Q12800 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TFCP2Q12800 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TFCP2Q12800 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TFCP2Q12800 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TFCP2Q12800 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TFCP2Q12800 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TFCP2Q12800 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TFCP2Q12800 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TFCP2Q12800 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TFCP2Q12800 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TFCP2Q12800 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TFCP2Q12800 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TFCP2Q12800 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TFCP2Q12800 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TFCP2Q12800 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TFCP2Q12800 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
TFCP2Q12800 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TFCP2Q12800 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TFCP2Q12800 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TFCP2Q12800 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TFCP2Q12800 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TFCP2Q12800 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TFCP2Q12800 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TFCP2Q12800 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TFCP2Q12800 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TFCP2Q12800 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TFCP2Q12800 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TFCP2Q12800 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TFCP2Q12800 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TFCP2Q12800 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TFCP2Q12800 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TFCP2Q12800 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TFCP2Q12800 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TFCP2Q12800 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TFCP2Q12800 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TFCP2Q12800 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TFCP2Q12800 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TFCP2Q12800 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TFCP2Q12800 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TFCP2Q12800 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TFCP2Q12800 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TFCP2Q12800 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TFCP2Q12800 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TFCP2Q12800 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TFCP2Q12800 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TFCP2Q12800 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TFCP2Q12800 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TFCP2Q12800 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TFCP2Q12800 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TFCP2Q12800 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TFCP2Q12800 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TFCP2Q12800 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TFCP2Q12800 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TFCP2Q12800 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TFCP2Q12800 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
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