Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SREBF2Q12772 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SREBF2Q12772 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SREBF2Q12772 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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