Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLFN5Q08AF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLFN5Q08AF3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SLFN5Q08AF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLFN5Q08AF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SLFN5Q08AF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms