Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF8Q02556 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF8Q02556 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF8Q02556 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms