Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS35P82673 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPS35P82673 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPS35P82673 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms