Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDSP20132 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SDSP20132 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SDSP20132 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDSP20132 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SDSP20132 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SDSP20132 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SDSP20132 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SDSP20132 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDSP20132 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SDSP20132 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SDSP20132 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SDSP20132 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDSP20132 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDSP20132 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDSP20132 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDSP20132 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDSP20132 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDSP20132 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDSP20132 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDSP20132 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDSP20132 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDSP20132 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDSP20132 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDSP20132 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SDSP20132 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SDSP20132 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SDSP20132 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SDSP20132 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SDSP20132 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SDSP20132 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SDSP20132 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SDSP20132 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SDSP20132 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SDSP20132 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SDSP20132 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDSP20132 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SDSP20132 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDSP20132 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDSP20132 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDSP20132 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SDSP20132 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SDSP20132 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SDSP20132 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SDSP20132 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SDSP20132 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SDSP20132 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SDSP20132 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SDSP20132 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SDSP20132 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SDSP20132 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SDSP20132 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SDSP20132 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SDSP20132 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SDSP20132 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SDSP20132 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SDSP20132 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDSP20132 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDSP20132 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDSP20132 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDSP20132 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDSP20132 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDSP20132 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDSP20132 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDSP20132 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDSP20132 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SDSP20132 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SDSP20132 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SDSP20132 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SDSP20132 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SDSP20132 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SDSP20132 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDSP20132 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDSP20132 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDSP20132 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDSP20132 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDSP20132 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDSP20132 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDSP20132 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDSP20132 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDSP20132 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDSP20132 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDSP20132 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SDSP20132 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SDSP20132 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SDSP20132 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SDSP20132 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SDSP20132 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms