Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB9P17482 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms