Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCA5LO95447 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LCA5LO95447 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5LO95447 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms