Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDKO14874 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDKO14874 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BCKDKO14874 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 336.7 ms