Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX2A2RU54 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX2A2RU54 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX2A2RU54 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms