Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0B3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087X0B3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0B3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms