Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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