Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A12Q9NXJ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A12Q9NXJ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A12Q9NXJ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms