Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HPF1Q9NWY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPF1Q9NWY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms