Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF4Q9BUZ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF4Q9BUZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF4Q9BUZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms