Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC2Q96PR1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC2Q96PR1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC2Q96PR1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms