Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SERAC1Q96JX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERAC1Q96JX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms