Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms