Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDXQ7Z353 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDXQ7Z353 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms