Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
METAP1DQ6UB28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms