Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8L3Q5GJ75 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms