Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM30BQ3MIR4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM30BQ3MIR4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms