Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK18Q07002 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK18Q07002 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK18Q07002 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms