Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHB1P54762 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB1P54762 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms