Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB12Q9Y5F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB12Q9Y5F1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms