Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIGD1AQ9Y241 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1AQ9Y241 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms