Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB23Q9ULC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB23Q9ULC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB23Q9ULC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms