Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABBR1Q9UBS5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABBR1Q9UBS5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABBR1Q9UBS5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABBR1Q9UBS5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms