Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 518.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 218.69■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 THOP1-213ENST00000591363 639 ntTSL 515.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 HSPG2-211ENST00000486901 3586 ntTSL 213.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 GLRX5-202ENST00000553672 912 ntTSL 27.71□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 34.56□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 34.4
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-214ENST00000496133 815 ntTSL 519.9■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 34.1
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-215ENST00000496553 888 ntTSL 219.57■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 34.1
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-204ENST00000467295 1060 ntTSL 319.57■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 34.1
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 218.2■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 34.1
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-206ENST00000473321 555 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 34.1
SDAD1Q9NVU7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-19■■■■■ 33.7
SDAD1Q9NVU7 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-19■■■■■ 33.7
SDAD1Q9NVU7 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-19■■■■■ 33.7
SDAD1Q9NVU7 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.691e-19■■■■■ 33.7
SDAD1Q9NVU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 33.6
SDAD1Q9NVU7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 33.6
SDAD1Q9NVU7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 33.4
SDAD1Q9NVU7 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 33.4
SDAD1Q9NVU7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 33.3
SDAD1Q9NVU7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 33.3
SDAD1Q9NVU7 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 33.3
SDAD1Q9NVU7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 33.3
SDAD1Q9NVU7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 33.3
SDAD1Q9NVU7 RXRB-203ENST00000481441 1330 ntTSL 215.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 33.3
SDAD1Q9NVU7 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 212.68□□□□□ -0.388e-11■■■■■ 33.2
SDAD1Q9NVU7 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 58.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 33.1
SDAD1Q9NVU7 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 33.1
SDAD1Q9NVU7 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 33.1
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-211ENST00000439154 1310 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-215ENST00000457277 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 TNS1-206ENST00000423413 548 ntTSL 310.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-202ENST00000340870 963 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 TNS1-211ENST00000449814 582 ntTSL 35.9□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 CFLAR-219ENST00000462763 588 ntTSL 24.07□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC12.43□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 33
SDAD1Q9NVU7 GRAMD1A-209ENST00000598580 400 ntTSL 310.05□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 225.62■■□□□ 1.691e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 ST3GAL2-205ENST00000567586 557 ntTSL 423.21■■□□□ 1.311e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 32.7
SDAD1Q9NVU7 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 32.6
SDAD1Q9NVU7 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 32.6
SDAD1Q9NVU7 STAT5B-203ENST00000468312 1799 ntTSL 1 (best)22.21■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 32.1
SDAD1Q9NVU7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 32.1
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-203ENST00000528322 549 ntTSL 417.36■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 31.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-204ENST00000528564 589 ntTSL 414.07□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 31.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-221ENST00000590242 637 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 31.9
SDAD1Q9NVU7 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 31.8
SDAD1Q9NVU7 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 313.71□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 31.8
SDAD1Q9NVU7 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 31.8
SDAD1Q9NVU7 COL9A2-203ENST00000417105 677 ntTSL 520.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 31.7
SDAD1Q9NVU7 COL9A2-208ENST00000488463 1005 ntTSL 513.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 31.7
SDAD1Q9NVU7 SLC39A4-208ENST00000531789 361 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 31.7
SDAD1Q9NVU7 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 519.96■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 31.7
SDAD1Q9NVU7 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 31.6
SDAD1Q9NVU7 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 512.6□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 31.6
SDAD1Q9NVU7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.122e-13■■■■■ 31.5
SDAD1Q9NVU7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.12e-13■■■■■ 31.5
SDAD1Q9NVU7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-10■■■■■ 31.5
SDAD1Q9NVU7 TMEM94-207ENST00000578624 583 ntTSL 411.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 31.5
SDAD1Q9NVU7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 31.5
SDAD1Q9NVU7 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 512.77□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 31.5
SDAD1Q9NVU7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 31.4
SDAD1Q9NVU7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 31.4
SDAD1Q9NVU7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 31.4
SDAD1Q9NVU7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 31.4
SDAD1Q9NVU7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 31.4
SDAD1Q9NVU7 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 215.43■□□□□ 0.064e-13■■■■■ 31.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-216ENST00000635406 506 ntTSL 419.38■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 31.3
SDAD1Q9NVU7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 31.3
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 310.4 ms