RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449814.1

TNS1-211, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-211ENST00000449814 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.06■□□□□ 0.32
TNS1-211ENST00000449814 ABCC9O60706 1549 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-211ENST00000449814 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS1-211ENST00000449814 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.99□□□□□ -0.01
TNS1-211ENST00000449814 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-211ENST00000449814 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TNS1-211ENST00000449814 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-211ENST00000449814 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-211ENST00000449814 NACADO15069 1562 aa14.48□□□□□ -0.09
TNS1-211ENST00000449814 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.42□□□□□ -0.1
TNS1-211ENST00000449814 SCRIBQ14160 1630 aa14.13□□□□□ -0.15
TNS1-211ENST00000449814 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.13□□□□□ -0.15
TNS1-211ENST00000449814 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.12□□□□□ -0.15
TNS1-211ENST00000449814 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TNS1-211ENST00000449814 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.05□□□□□ -0.16
TNS1-211ENST00000449814 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
TNS1-211ENST00000449814 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa13.93□□□□□ -0.18
TNS1-211ENST00000449814 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.84□□□□□ -0.19
TNS1-211ENST00000449814 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.67□□□□□ -0.22
TNS1-211ENST00000449814 NESP48681 1621 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-211ENST00000449814 ERCC6Q03468 1493 aa13.42□□□□□ -0.26
TNS1-211ENST00000449814 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.42□□□□□ -0.26
TNS1-211ENST00000449814 NCAPD3P42695 1498 aa13.41□□□□□ -0.26
TNS1-211ENST00000449814 SMARCA4P51532 1647 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-211ENST00000449814 CUX2O14529 1486 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-211ENST00000449814 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TNS1-211ENST00000449814 HMGXB3Q12766 1538 aa13.28□□□□□ -0.28
TNS1-211ENST00000449814 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.27□□□□□ -0.29
TNS1-211ENST00000449814 SMARCA2P51531 1590 aa13.25□□□□□ -0.29
TNS1-211ENST00000449814 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.24□□□□□ -0.29
TNS1-211ENST00000449814 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TNS1-211ENST00000449814 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TNS1-211ENST00000449814 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-211ENST00000449814 WIZO95785 1651 aa13.12□□□□□ -0.31
TNS1-211ENST00000449814 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.12□□□□□ -0.31
TNS1-211ENST00000449814 TRIM41Q8WV44 630 aa13.12□□□□□ -0.31
TNS1-211ENST00000449814 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-211ENST00000449814 CADPSQ9ULU8 1353 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-211ENST00000449814 WDR62O43379 1518 aa12.98□□□□□ -0.33
TNS1-211ENST00000449814 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.98□□□□□ -0.33
TNS1-211ENST00000449814 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-211ENST00000449814 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-211ENST00000449814 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-211ENST00000449814 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-211ENST00000449814 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TNS1-211ENST00000449814 CFTRP13569 1480 aa12.83□□□□□ -0.36
TNS1-211ENST00000449814 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
TNS1-211ENST00000449814 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
TNS1-211ENST00000449814 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-211ENST00000449814 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-211ENST00000449814 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-211ENST00000449814 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-211ENST00000449814 OSCARQ8IYS5 282 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-211ENST00000449814 PRDM2Q13029 1718 aa12.73□□□□□ -0.37
TNS1-211ENST00000449814 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.72□□□□□ -0.37
TNS1-211ENST00000449814 ARHGEF11O15085 1522 aa12.67□□□□□ -0.38
TNS1-211ENST00000449814 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TNS1-211ENST00000449814 TOPBP1Q92547 1522 aa12.66□□□□□ -0.38
TNS1-211ENST00000449814 CHD1O14646 1710 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-211ENST00000449814 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.392e-7■■■□□ 18.3
TNS1-211ENST00000449814 IFT140Q96RY7 1462 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-211ENST00000449814 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-211ENST00000449814 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-211ENST00000449814 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-211ENST00000449814 ARAP1Q96P48 1450 aa12.56□□□□□ -0.4
TNS1-211ENST00000449814 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.56□□□□□ -0.4
TNS1-211ENST00000449814 FBLN2P98095 1184 aa12.54□□□□□ -0.4
TNS1-211ENST00000449814 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
TNS1-211ENST00000449814 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
TNS1-211ENST00000449814 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
TNS1-211ENST00000449814 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-211ENST00000449814 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.44□□□□□ -0.42
TNS1-211ENST00000449814 CUX1P39880 1505 aa12.43□□□□□ -0.42
TNS1-211ENST00000449814 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-211ENST00000449814 SOGA1O94964 1423 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-211ENST00000449814 ABCC8Q09428 1581 aa12.41□□□□□ -0.42
TNS1-211ENST00000449814 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.39□□□□□ -0.43
TNS1-211ENST00000449814 WDR97A6NE52 1622 aa12.38□□□□□ -0.43
TNS1-211ENST00000449814 PBRM1Q86U86 1689 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-211ENST00000449814 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 SYNJ1O43426 1573 aa12.3□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 GRIN2BQ13224 1484 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 SYNJ2O15056 1496 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.27□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.27□□□□□ -0.44
TNS1-211ENST00000449814 CEP170Q5SW79 1584 aa12.25□□□□□ -0.45
TNS1-211ENST00000449814 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TNS1-211ENST00000449814 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.21□□□□□ -0.46
TNS1-211ENST00000449814 ADAMTS12P58397 1594 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-211ENST00000449814 GRIN2AQ12879 1464 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-211ENST00000449814 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-211ENST00000449814 SHROOM2Q13796 1616 aa12.14□□□□□ -0.47
TNS1-211ENST00000449814 NUP160Q12769 1436 aa12.13□□□□□ -0.47
TNS1-211ENST00000449814 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.12□□□□□ -0.47
TNS1-211ENST00000449814 TOP2BQ02880 1626 aa12.11□□□□□ -0.47
TNS1-211ENST00000449814 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
TNS1-211ENST00000449814 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TNS1-211ENST00000449814 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.05□□□□□ -0.48
TNS1-211ENST00000449814 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 187.3 ms