Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARS2Q9NP81 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARS2Q9NP81 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARS2Q9NP81 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARS2Q9NP81 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms