Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLRE1BQ9H816 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1BQ9H816 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1BQ9H816 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1BQ9H816 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms