Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGF29Q96ES7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGF29Q96ES7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGF29Q96ES7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms